Sēnīšu infekcijas bieži rodas vienkāršas organismā dabiski esošo mikroorganismu nelīdzsvarotības dēļ.

Faktiski to kolonizē daudzas dažādas sēnītes un baktērijas, kas lielākoties ir nekaitīgas un pat nepieciešamas pareizai ķermeņa darbībai.

Tomēr var gadīties, ka dažas no šīm sēnītēm vairojas un kļūst patogēnas, vai arī infekciju izraisa “ārēja” sēne, ko pārnēsā, piemēram, dzīvnieks. Pavisam 200-400 sēņu sugas var izraisīt cilvēku slimības⁵.

Tomēr vidē esošās sēnītes var piesārņot arī cilvēkus, piemēram:

• ar inokulāciju, piemēram, traumas laikā (kas izraisa sporotrihozi vai hromomikozi utt.);
• ieelpojot pelējuma sēnītes (histoplazmoze, aergiloze utt.);
• saskaroties ar inficētu personu (kandidoze, cirpējēdes utt.);
• saskaroties ar inficētu dzīvnieku.